Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTL2

Rab25, Ras-related protein Rab-25, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab25Q9WTL2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rab25Q9WTL2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab25Q9WTL2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rab25Q9WTL2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab25Q9WTL2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab25Q9WTL2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rab25Q9WTL2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rab25Q9WTL2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rab25Q9WTL2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rab25Q9WTL2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rab25Q9WTL2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab25Q9WTL2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab25Q9WTL2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab25Q9WTL2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab25Q9WTL2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab25Q9WTL2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab25Q9WTL2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab25Q9WTL2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab25Q9WTL2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab25Q9WTL2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms