Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1X5

Abcc5, Multidrug resistance-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc5Q9R1X5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Abcc5Q9R1X5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Abcc5Q9R1X5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Abcc5Q9R1X5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Abcc5Q9R1X5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
Abcc5Q9R1X5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
Abcc5Q9R1X5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Abcc5Q9R1X5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Abcc5Q9R1X5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Abcc5Q9R1X5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Abcc5Q9R1X5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc5Q9R1X5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Abcc5Q9R1X5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Abcc5Q9R1X5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Abcc5Q9R1X5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc5Q9R1X5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Abcc5Q9R1X5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Abcc5Q9R1X5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc5Q9R1X5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc5Q9R1X5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Abcc5Q9R1X5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Abcc5Q9R1X5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Abcc5Q9R1X5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Abcc5Q9R1X5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Abcc5Q9R1X5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Abcc5Q9R1X5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Abcc5Q9R1X5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Abcc5Q9R1X5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Abcc5Q9R1X5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Abcc5Q9R1X5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Abcc5Q9R1X5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Abcc5Q9R1X5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Abcc5Q9R1X5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Abcc5Q9R1X5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Abcc5Q9R1X5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Abcc5Q9R1X5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Abcc5Q9R1X5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Abcc5Q9R1X5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Abcc5Q9R1X5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Abcc5Q9R1X5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Abcc5Q9R1X5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Abcc5Q9R1X5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Abcc5Q9R1X5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Abcc5Q9R1X5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Abcc5Q9R1X5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Abcc5Q9R1X5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Abcc5Q9R1X5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Abcc5Q9R1X5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Abcc5Q9R1X5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Abcc5Q9R1X5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Abcc5Q9R1X5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Abcc5Q9R1X5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Abcc5Q9R1X5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Abcc5Q9R1X5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Abcc5Q9R1X5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Abcc5Q9R1X5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Abcc5Q9R1X5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Abcc5Q9R1X5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Abcc5Q9R1X5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Abcc5Q9R1X5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
Abcc5Q9R1X5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Abcc5Q9R1X5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Abcc5Q9R1X5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Abcc5Q9R1X5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Abcc5Q9R1X5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Abcc5Q9R1X5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms