Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Psmb2Q9R1P3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Psmb2Q9R1P3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psmb2Q9R1P3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psmb2Q9R1P3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Psmb2Q9R1P3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb2Q9R1P3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb2Q9R1P3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms