Protein–RNA interactions for Protein: Q9R100

Cdh17, Cadherin-17, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh17Q9R100 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh17Q9R100 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh17Q9R100 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh17Q9R100 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdh17Q9R100 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh17Q9R100 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdh17Q9R100 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh17Q9R100 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh17Q9R100 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh17Q9R100 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh17Q9R100 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh17Q9R100 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh17Q9R100 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh17Q9R100 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh17Q9R100 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh17Q9R100 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms