Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4eQ9R0Q8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clec4eQ9R0Q8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clec4eQ9R0Q8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clec4eQ9R0Q8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec4eQ9R0Q8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clec4eQ9R0Q8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec4eQ9R0Q8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec4eQ9R0Q8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4eQ9R0Q8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4eQ9R0Q8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clec4eQ9R0Q8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Clec4eQ9R0Q8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4eQ9R0Q8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4eQ9R0Q8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4eQ9R0Q8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec4eQ9R0Q8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms