Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plod2Q9R0B9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Plod2Q9R0B9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod2Q9R0B9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod2Q9R0B9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Plod2Q9R0B9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Plod2Q9R0B9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Plod2Q9R0B9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Plod2Q9R0B9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms