Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rnf4Q9QZS2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rnf4Q9QZS2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rnf4Q9QZS2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rnf4Q9QZS2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf4Q9QZS2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf4Q9QZS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf4Q9QZS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf4Q9QZS2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf4Q9QZS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf4Q9QZS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf4Q9QZS2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms