Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChmlQ9QZD5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChmlQ9QZD5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ChmlQ9QZD5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChmlQ9QZD5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChmlQ9QZD5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChmlQ9QZD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ChmlQ9QZD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChmlQ9QZD5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChmlQ9QZD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChmlQ9QZD5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChmlQ9QZD5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChmlQ9QZD5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ChmlQ9QZD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChmlQ9QZD5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChmlQ9QZD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ChmlQ9QZD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChmlQ9QZD5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChmlQ9QZD5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChmlQ9QZD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ChmlQ9QZD5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChmlQ9QZD5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ChmlQ9QZD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChmlQ9QZD5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChmlQ9QZD5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChmlQ9QZD5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChmlQ9QZD5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChmlQ9QZD5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChmlQ9QZD5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ChmlQ9QZD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ChmlQ9QZD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChmlQ9QZD5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ChmlQ9QZD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ChmlQ9QZD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ChmlQ9QZD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ChmlQ9QZD5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ChmlQ9QZD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChmlQ9QZD5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChmlQ9QZD5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChmlQ9QZD5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ChmlQ9QZD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChmlQ9QZD5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChmlQ9QZD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChmlQ9QZD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ChmlQ9QZD5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChmlQ9QZD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChmlQ9QZD5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ChmlQ9QZD5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms