Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rdh11Q9QYF1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rdh11Q9QYF1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rdh11Q9QYF1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdh11Q9QYF1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdh11Q9QYF1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rdh11Q9QYF1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rdh11Q9QYF1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rdh11Q9QYF1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rdh11Q9QYF1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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