Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hacd1Q9QY80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hacd1Q9QY80 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hacd1Q9QY80 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hacd1Q9QY80 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd1Q9QY80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd1Q9QY80 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd1Q9QY80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd1Q9QY80 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacd1Q9QY80 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hacd1Q9QY80 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hacd1Q9QY80 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hacd1Q9QY80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hacd1Q9QY80 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hacd1Q9QY80 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hacd1Q9QY80 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms