Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tinf2Q9QXG9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tinf2Q9QXG9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tinf2Q9QXG9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tinf2Q9QXG9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tinf2Q9QXG9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tinf2Q9QXG9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tinf2Q9QXG9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tinf2Q9QXG9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms