Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Krt17Q9QWL7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Krt17Q9QWL7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Krt17Q9QWL7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Krt17Q9QWL7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Krt17Q9QWL7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Krt17Q9QWL7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Krt17Q9QWL7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Krt17Q9QWL7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Krt17Q9QWL7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Krt17Q9QWL7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krt17Q9QWL7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt17Q9QWL7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt17Q9QWL7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krt17Q9QWL7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt17Q9QWL7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt17Q9QWL7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt17Q9QWL7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Krt17Q9QWL7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt17Q9QWL7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt17Q9QWL7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt17Q9QWL7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt17Q9QWL7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt17Q9QWL7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms