Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Reg3dQ9QUS9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Reg3dQ9QUS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Reg3dQ9QUS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Reg3dQ9QUS9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reg3dQ9QUS9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Reg3dQ9QUS9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms