Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dnaja4Q9JMC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnaja4Q9JMC3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Dnaja4Q9JMC3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnaja4Q9JMC3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaja4Q9JMC3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaja4Q9JMC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaja4Q9JMC3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnaja4Q9JMC3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms