Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh9a1Q9JLJ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh9a1Q9JLJ2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Aldh9a1Q9JLJ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh9a1Q9JLJ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh9a1Q9JLJ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh9a1Q9JLJ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh9a1Q9JLJ2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms