Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Habp4Q9JKS5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Habp4Q9JKS5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Habp4Q9JKS5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Habp4Q9JKS5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Habp4Q9JKS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Habp4Q9JKS5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Habp4Q9JKS5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Habp4Q9JKS5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Habp4Q9JKS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Habp4Q9JKS5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Habp4Q9JKS5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Habp4Q9JKS5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Habp4Q9JKS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Habp4Q9JKS5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Habp4Q9JKS5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Habp4Q9JKS5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Habp4Q9JKS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Habp4Q9JKS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Habp4Q9JKS5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Habp4Q9JKS5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Habp4Q9JKS5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Habp4Q9JKS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Habp4Q9JKS5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Habp4Q9JKS5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Habp4Q9JKS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Habp4Q9JKS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Habp4Q9JKS5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Habp4Q9JKS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Habp4Q9JKS5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Habp4Q9JKS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Habp4Q9JKS5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Habp4Q9JKS5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Habp4Q9JKS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Habp4Q9JKS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Habp4Q9JKS5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Habp4Q9JKS5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Habp4Q9JKS5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Habp4Q9JKS5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Habp4Q9JKS5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Habp4Q9JKS5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Habp4Q9JKS5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Habp4Q9JKS5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Habp4Q9JKS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms