Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mrpl39Q9JKF7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mrpl39Q9JKF7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mrpl39Q9JKF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mrpl39Q9JKF7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrpl39Q9JKF7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrpl39Q9JKF7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mrpl39Q9JKF7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mrpl39Q9JKF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mrpl39Q9JKF7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mrpl39Q9JKF7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl39Q9JKF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mrpl39Q9JKF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mrpl39Q9JKF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mrpl39Q9JKF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms