Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cacng4Q9JJV4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacng4Q9JJV4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacng4Q9JJV4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacng4Q9JJV4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacng4Q9JJV4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacng4Q9JJV4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacng4Q9JJV4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacng4Q9JJV4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacng4Q9JJV4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacng4Q9JJV4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacng4Q9JJV4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacng4Q9JJV4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacng4Q9JJV4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacng4Q9JJV4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacng4Q9JJV4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacng4Q9JJV4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacng4Q9JJV4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacng4Q9JJV4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacng4Q9JJV4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cacng4Q9JJV4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacng4Q9JJV4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacng4Q9JJV4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cacng4Q9JJV4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacng4Q9JJV4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cacng4Q9JJV4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacng4Q9JJV4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cacng4Q9JJV4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cacng4Q9JJV4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cacng4Q9JJV4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacng4Q9JJV4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cacng4Q9JJV4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacng4Q9JJV4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cacng4Q9JJV4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacng4Q9JJV4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cacng4Q9JJV4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms