Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cacna1fQ9JIS7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cacna1fQ9JIS7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cacna1fQ9JIS7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cacna1fQ9JIS7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cacna1fQ9JIS7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cacna1fQ9JIS7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cacna1fQ9JIS7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cacna1fQ9JIS7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cacna1fQ9JIS7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cacna1fQ9JIS7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cacna1fQ9JIS7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cacna1fQ9JIS7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cacna1fQ9JIS7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cacna1fQ9JIS7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cacna1fQ9JIS7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Cacna1fQ9JIS7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cacna1fQ9JIS7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cacna1fQ9JIS7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cacna1fQ9JIS7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cacna1fQ9JIS7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacna1fQ9JIS7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cacna1fQ9JIS7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cacna1fQ9JIS7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cacna1fQ9JIS7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cacna1fQ9JIS7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacna1fQ9JIS7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cacna1fQ9JIS7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacna1fQ9JIS7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cacna1fQ9JIS7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cacna1fQ9JIS7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms