Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM5

Yipf7, Protein YIPF7, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf7Q9JIM5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf7Q9JIM5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yipf7Q9JIM5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf7Q9JIM5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf7Q9JIM5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Yipf7Q9JIM5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf7Q9JIM5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Yipf7Q9JIM5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Yipf7Q9JIM5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Yipf7Q9JIM5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Yipf7Q9JIM5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Yipf7Q9JIM5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Yipf7Q9JIM5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Yipf7Q9JIM5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf7Q9JIM5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf7Q9JIM5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf7Q9JIM5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf7Q9JIM5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Yipf7Q9JIM5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms