Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pgpep1Q9ESW8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgpep1Q9ESW8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgpep1Q9ESW8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pgpep1Q9ESW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Pgpep1Q9ESW8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pgpep1Q9ESW8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pgpep1Q9ESW8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Pgpep1Q9ESW8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pgpep1Q9ESW8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pgpep1Q9ESW8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pgpep1Q9ESW8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Pgpep1Q9ESW8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Pgpep1Q9ESW8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Pgpep1Q9ESW8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pgpep1Q9ESW8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Pgpep1Q9ESW8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pgpep1Q9ESW8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Pgpep1Q9ESW8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Pgpep1Q9ESW8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pgpep1Q9ESW8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pgpep1Q9ESW8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms