Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI5

Jmjd6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd6Q9ERI5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Jmjd6Q9ERI5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd6Q9ERI5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Jmjd6Q9ERI5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Jmjd6Q9ERI5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Jmjd6Q9ERI5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Jmjd6Q9ERI5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Jmjd6Q9ERI5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Jmjd6Q9ERI5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms