Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Clstn2Q9ER65 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Clstn2Q9ER65 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Clstn2Q9ER65 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Clstn2Q9ER65 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Clstn2Q9ER65 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Clstn2Q9ER65 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Clstn2Q9ER65 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Clstn2Q9ER65 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Clstn2Q9ER65 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Clstn2Q9ER65 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Clstn2Q9ER65 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Clstn2Q9ER65 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Clstn2Q9ER65 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Clstn2Q9ER65 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Clstn2Q9ER65 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Clstn2Q9ER65 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Clstn2Q9ER65 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Clstn2Q9ER65 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Clstn2Q9ER65 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Clstn2Q9ER65 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Clstn2Q9ER65 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Clstn2Q9ER65 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Clstn2Q9ER65 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Clstn2Q9ER65 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Clstn2Q9ER65 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Clstn2Q9ER65 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Clstn2Q9ER65 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Clstn2Q9ER65 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Clstn2Q9ER65 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Clstn2Q9ER65 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Clstn2Q9ER65 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Clstn2Q9ER65 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Clstn2Q9ER65 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Clstn2Q9ER65 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Clstn2Q9ER65 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Clstn2Q9ER65 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Clstn2Q9ER65 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Clstn2Q9ER65 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Clstn2Q9ER65 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Clstn2Q9ER65 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Clstn2Q9ER65 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Clstn2Q9ER65 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Clstn2Q9ER65 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Clstn2Q9ER65 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Clstn2Q9ER65 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
Clstn2Q9ER65 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Clstn2Q9ER65 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Clstn2Q9ER65 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Clstn2Q9ER65 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Clstn2Q9ER65 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Clstn2Q9ER65 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Clstn2Q9ER65 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Clstn2Q9ER65 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms