Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps35Q9EQH3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vps35Q9EQH3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vps35Q9EQH3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vps35Q9EQH3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps35Q9EQH3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vps35Q9EQH3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Vps35Q9EQH3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps35Q9EQH3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vps35Q9EQH3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vps35Q9EQH3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps35Q9EQH3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vps35Q9EQH3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps35Q9EQH3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps35Q9EQH3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps35Q9EQH3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps35Q9EQH3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Vps35Q9EQH3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps35Q9EQH3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vps35Q9EQH3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps35Q9EQH3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps35Q9EQH3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps35Q9EQH3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vps35Q9EQH3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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