Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc38a3Q9DCP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc38a3Q9DCP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc38a3Q9DCP2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a3Q9DCP2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a3Q9DCP2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc38a3Q9DCP2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc38a3Q9DCP2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc38a3Q9DCP2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms