Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Xab2Q9DCD2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Xab2Q9DCD2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Xab2Q9DCD2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Xab2Q9DCD2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Xab2Q9DCD2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Xab2Q9DCD2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Xab2Q9DCD2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Xab2Q9DCD2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Xab2Q9DCD2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Xab2Q9DCD2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Xab2Q9DCD2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Xab2Q9DCD2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Xab2Q9DCD2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Xab2Q9DCD2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Xab2Q9DCD2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Xab2Q9DCD2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Xab2Q9DCD2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Xab2Q9DCD2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Xab2Q9DCD2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Xab2Q9DCD2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms