Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Riok3Q9DBU3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Riok3Q9DBU3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Riok3Q9DBU3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Riok3Q9DBU3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Riok3Q9DBU3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Riok3Q9DBU3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Riok3Q9DBU3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Riok3Q9DBU3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Riok3Q9DBU3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Riok3Q9DBU3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Riok3Q9DBU3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Riok3Q9DBU3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Riok3Q9DBU3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Riok3Q9DBU3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Riok3Q9DBU3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Riok3Q9DBU3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Riok3Q9DBU3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms