Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SelenooQ9DBC0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SelenooQ9DBC0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SelenooQ9DBC0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SelenooQ9DBC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SelenooQ9DBC0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SelenooQ9DBC0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SelenooQ9DBC0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SelenooQ9DBC0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SelenooQ9DBC0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SelenooQ9DBC0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SelenooQ9DBC0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SelenooQ9DBC0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SelenooQ9DBC0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SelenooQ9DBC0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SelenooQ9DBC0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SelenooQ9DBC0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms