Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB76

Emc9, ER membrane protein complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc9Q9DB76 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Emc9Q9DB76 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emc9Q9DB76 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Emc9Q9DB76 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Emc9Q9DB76 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Emc9Q9DB76 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Emc9Q9DB76 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Emc9Q9DB76 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Emc9Q9DB76 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Emc9Q9DB76 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Emc9Q9DB76 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Emc9Q9DB76 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Emc9Q9DB76 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Emc9Q9DB76 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Emc9Q9DB76 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms