Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Smdt1Q9DB10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smdt1Q9DB10 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smdt1Q9DB10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smdt1Q9DB10 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smdt1Q9DB10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smdt1Q9DB10 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smdt1Q9DB10 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smdt1Q9DB10 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms