Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU9

Znf654, Zinc finger protein 654, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf654Q9DAU9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znf654Q9DAU9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znf654Q9DAU9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Znf654Q9DAU9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znf654Q9DAU9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znf654Q9DAU9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znf654Q9DAU9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf654Q9DAU9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf654Q9DAU9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf654Q9DAU9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf654Q9DAU9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf654Q9DAU9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf654Q9DAU9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf654Q9DAU9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf654Q9DAU9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf654Q9DAU9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf654Q9DAU9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf654Q9DAU9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf654Q9DAU9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms