Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm2aQ9DAR1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm2aQ9DAR1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm2aQ9DAR1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm2aQ9DAR1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm2aQ9DAR1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmtm2aQ9DAR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cmtm2aQ9DAR1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms