Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Subh2bvQ9D9Z7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Subh2bvQ9D9Z7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Subh2bvQ9D9Z7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Subh2bvQ9D9Z7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Subh2bvQ9D9Z7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Subh2bvQ9D9Z7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Subh2bvQ9D9Z7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Subh2bvQ9D9Z7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Subh2bvQ9D9Z7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Subh2bvQ9D9Z7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Subh2bvQ9D9Z7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Subh2bvQ9D9Z7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Subh2bvQ9D9Z7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Subh2bvQ9D9Z7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Subh2bvQ9D9Z7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms