Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pradc1Q9D9N8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pradc1Q9D9N8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pradc1Q9D9N8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pradc1Q9D9N8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pradc1Q9D9N8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pradc1Q9D9N8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pradc1Q9D9N8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pradc1Q9D9N8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pradc1Q9D9N8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pradc1Q9D9N8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pradc1Q9D9N8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pradc1Q9D9N8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pradc1Q9D9N8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pradc1Q9D9N8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pradc1Q9D9N8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pradc1Q9D9N8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms