Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700109H08RikQ9D9C0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700109H08RikQ9D9C0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700109H08RikQ9D9C0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
1700109H08RikQ9D9C0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700109H08RikQ9D9C0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700109H08RikQ9D9C0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
1700109H08RikQ9D9C0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700109H08RikQ9D9C0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700109H08RikQ9D9C0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700109H08RikQ9D9C0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
1700109H08RikQ9D9C0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms