Protein–RNA interactions for Protein: Q9D976

Trp53tg5, Transformation-related protein 53 target 5, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53tg5Q9D976 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trp53tg5Q9D976 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trp53tg5Q9D976 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53tg5Q9D976 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53tg5Q9D976 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53tg5Q9D976 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trp53tg5Q9D976 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53tg5Q9D976 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53tg5Q9D976 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53tg5Q9D976 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trp53tg5Q9D976 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trp53tg5Q9D976 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trp53tg5Q9D976 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms