Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sec11cQ9D8V7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec11cQ9D8V7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec11cQ9D8V7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sec11cQ9D8V7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sec11cQ9D8V7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sec11cQ9D8V7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sec11cQ9D8V7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sec11cQ9D8V7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Sec11cQ9D8V7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms