Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Alkbh4Q9D8F1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Alkbh4Q9D8F1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Alkbh4Q9D8F1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Alkbh4Q9D8F1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Alkbh4Q9D8F1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Alkbh4Q9D8F1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Alkbh4Q9D8F1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Alkbh4Q9D8F1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Alkbh4Q9D8F1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Alkbh4Q9D8F1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Alkbh4Q9D8F1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Alkbh4Q9D8F1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Alkbh4Q9D8F1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms