Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fip1l1Q9D824 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fip1l1Q9D824 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fip1l1Q9D824 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fip1l1Q9D824 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fip1l1Q9D824 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fip1l1Q9D824 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fip1l1Q9D824 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fip1l1Q9D824 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fip1l1Q9D824 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fip1l1Q9D824 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fip1l1Q9D824 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fip1l1Q9D824 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fip1l1Q9D824 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fip1l1Q9D824 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fip1l1Q9D824 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fip1l1Q9D824 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fip1l1Q9D824 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fip1l1Q9D824 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fip1l1Q9D824 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Fip1l1Q9D824 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Fip1l1Q9D824 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms