Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vstm5Q9D806 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm5Q9D806 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm5Q9D806 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vstm5Q9D806 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vstm5Q9D806 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm5Q9D806 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vstm5Q9D806 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vstm5Q9D806 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vstm5Q9D806 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vstm5Q9D806 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vstm5Q9D806 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm5Q9D806 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vstm5Q9D806 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vstm5Q9D806 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm5Q9D806 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vstm5Q9D806 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vstm5Q9D806 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vstm5Q9D806 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vstm5Q9D806 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms