Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9D7E4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D7E4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9D7E4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9D7E4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9D7E4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D7E4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D7E4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9D7E4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9D7E4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D7E4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9D7E4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms