Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rpap3Q9D706 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Rpap3Q9D706 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rpap3Q9D706 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap3Q9D706 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rpap3Q9D706 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpap3Q9D706 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rpap3Q9D706 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rpap3Q9D706 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rpap3Q9D706 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rpap3Q9D706 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rpap3Q9D706 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rpap3Q9D706 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rpap3Q9D706 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap3Q9D706 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap3Q9D706 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rpap3Q9D706 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rpap3Q9D706 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap3Q9D706 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rpap3Q9D706 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap3Q9D706 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap3Q9D706 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rpap3Q9D706 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rpap3Q9D706 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rpap3Q9D706 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rpap3Q9D706 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpap3Q9D706 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap3Q9D706 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpap3Q9D706 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms