Protein–RNA interactions for Protein: Q9D701

Upk3bl1, Uroplakin-3b-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bl1Q9D701 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Upk3bl1Q9D701 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Upk3bl1Q9D701 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upk3bl1Q9D701 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Upk3bl1Q9D701 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Upk3bl1Q9D701 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upk3bl1Q9D701 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upk3bl1Q9D701 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk3bl1Q9D701 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Upk3bl1Q9D701 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upk3bl1Q9D701 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upk3bl1Q9D701 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk3bl1Q9D701 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upk3bl1Q9D701 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upk3bl1Q9D701 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms