Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6V8

Paip2, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip2Q9D6V8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paip2Q9D6V8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Paip2Q9D6V8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Paip2Q9D6V8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Paip2Q9D6V8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Paip2Q9D6V8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Paip2Q9D6V8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paip2Q9D6V8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paip2Q9D6V8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms