Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D4W2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D4W2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D4W2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D4W2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D4W2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D4W2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D4W2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D4W2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D4W2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D4W2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D4W2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D4W2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D4W2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D4W2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D4W2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D4W2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D4W2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D4W2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q9D4W2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q9D4W2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q9D4W2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9D4W2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D4W2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D4W2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D4W2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms