Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fam227aQ9D3V8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fam227aQ9D3V8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam227aQ9D3V8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam227aQ9D3V8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam227aQ9D3V8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam227aQ9D3V8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227aQ9D3V8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam227aQ9D3V8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam227aQ9D3V8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fam227aQ9D3V8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam227aQ9D3V8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam227aQ9D3V8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam227aQ9D3V8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam227aQ9D3V8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam227aQ9D3V8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam227aQ9D3V8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.4 ms