Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed11Q9D2R4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed11Q9D2R4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed11Q9D2R4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmed11Q9D2R4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed11Q9D2R4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmed11Q9D2R4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmed11Q9D2R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed11Q9D2R4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmed11Q9D2R4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmed11Q9D2R4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmed11Q9D2R4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmed11Q9D2R4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmed11Q9D2R4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms