Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chordc1Q9D1P4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chordc1Q9D1P4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chordc1Q9D1P4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chordc1Q9D1P4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chordc1Q9D1P4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chordc1Q9D1P4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chordc1Q9D1P4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chordc1Q9D1P4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chordc1Q9D1P4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chordc1Q9D1P4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Chordc1Q9D1P4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chordc1Q9D1P4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chordc1Q9D1P4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Chordc1Q9D1P4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chordc1Q9D1P4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chordc1Q9D1P4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chordc1Q9D1P4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chordc1Q9D1P4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chordc1Q9D1P4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chordc1Q9D1P4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chordc1Q9D1P4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Chordc1Q9D1P4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms