Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hddc3Q9D114 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hddc3Q9D114 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hddc3Q9D114 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hddc3Q9D114 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hddc3Q9D114 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hddc3Q9D114 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hddc3Q9D114 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hddc3Q9D114 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hddc3Q9D114 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hddc3Q9D114 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hddc3Q9D114 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Hddc3Q9D114 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hddc3Q9D114 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hddc3Q9D114 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hddc3Q9D114 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
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