Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ift27Q9D0P8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ift27Q9D0P8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ift27Q9D0P8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ift27Q9D0P8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ift27Q9D0P8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ift27Q9D0P8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ift27Q9D0P8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift27Q9D0P8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift27Q9D0P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ift27Q9D0P8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ift27Q9D0P8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms